Martinenghi respondió ante el magistrado y los fiscales federales Eamon Mullen y José Barbaccia respecto del pago de 500 mil pesos que Alsogaray asegura haber recibido en concepto de "honorarios" por tareas de asesoramiento a los "Astilleros Alianza", cuando la empresa naviera se encontraba al borde de la liquidación.
Los representantes del ministerio público sospechan que Martinenghi pudo haber ayudado de ese modo a justificar parte de la fortuna de la ex secretaria de Medio Ambiente, ya que las constancias presentadas no especifican el tipo de asesoramiento brindado por la ex funcionaria, ni justifican la razón por la cual percibió tan importante suma de dinero.
Martinenghi también está siendo investigado por el juez federal Rodolfo Canicoba Corral, a raíz de una causa iniciada por Galeano por la desaparición de un libro de registros de los Astilleros Alianza, que los abogados defensores pidieron en el juzgado, comprometiéndose a devolverlo al expediente.
Los letrados, según confiaron fuentes cercanas a la investigación, argumentaron que necesitaban el libro para presentarlo "como constancia" en la causa que se sigue por la quiebra de los astilleros, y se hicieron depositarios del mismo, pero luego, y al ser reclamado por Galeano, dijeron que ya no lo tenían, por lo que el magistrado efectuó la correspondiente denuncia.
De todos modos, en la causa contra la ex funcionaria se encuentra incorporada una fotocopia certificada de ese libro, donde se encontraban asentados los movimientos de fondos de la firma.