El Gobierno del ex presidente Alberto Fujimori -actualmente recluido en Japón- rechazó en 1999, tanto las objeciones que formuló al proceso la Corte Interamericana, que tiene su sede en San José de Costa Rica, como la jurisdicción de la Corte en la aplicación de la Convención Americana de Derechos Humanos.
Pero el Gobierno de transición del presidente Valentín Paniagua que asumió luego de la renuncia de Fujimori reconoció nuevamente la jurisdicción del tribunal interamericano para luego aceptar su responsabilidad internacional en el caso de Barrios Altos y dejó abierta la posibilidad para un nuevo juicio a los cuatro supuestos guerrilleros.
Las autoridades peruanas decidieron así volver al camino del respeto de los derechos humanos y "acatar el fallo dictado en 1999 por la Corte Interamericana", que cuestionó el juicio en el que fueron sentenciados los cuatro guerrilleros chilenos, miembros del MRTA (Movimiento Revolucionario Tupac Amaru), señaló Pérez de Cuéllar.
El ex secretario general de las Naciones Unidas viajó a Chile para participar en las reuniones de la conferencia de los cancilleres del Grupo de Río y en las reuniones de este bloque con la Unión Europea y los países del Asia del Este.
Los chilenos Jaime Castillo, Lautaro Mellado, Alejandro Astorga y María Concepción Pincheira cumplen sus condenas desde 1993 en la cárcel de Yanamayo, una localidad peruana cercana a la frontera con Bolivia.
El MRTA había asaltado la residencia del embajador japonés en Lima, tomando a todos las personas que la ocupaban como rehenes por semanas. En una operación encabezada por el entonces presidente Fujimori, fuerzas especiales del Ejército entraron al lugar y ninguno de los revolucionarios salió con vida. Actualmente, en ese país andino se está investigando si hubo totruras y ejecuciones sumarias a los guerrilleros.
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