El diputado electo en los comicios de fines del 2005, fue impugnado por el cuerpo legislativo por los delitos de lesa humanidad que se lo acusaba haber cometido durante la última dictadora militar. Como consecuencia de ello, promovió una acción de amparo solicitando se dejara sin efecto la resolución dictada por la Cámara de Diputados de la Nación, que rechazó su incorporación.
En primera instancia se revocó el amparo deducido. Sin embargo luego la Cámara Electoral se opuso a esta decisión, e hizo lugar al recurso interpuesto, lo que originó que la Cámara Baja interponga un extraordinario que el Máximo Tribunal le rechazó, determinado que Patti está habilitado legalmente para asumir su cargo.
Así ratificó la decisión del fuero electoral que había señalado que cuando el candidato se registra ante la Justicia, y además gana una elección, queda automáticamente habilitado para ejercer el cargo y ninguna de las cámaras del Congreso puede impedir su ingreso.
Al respecto, el Procurador General señaló que “la Cámara de Diputados de la Nación, al juzgar el diploma de Luis Abelardo Patti, había excedido su potestad constitucional (artículo 64 de la Constitución Nacional).”
La decisión, fue adoptada por los ministros Ricardo Lorenzetti, Carlos Fayt, Eugenio Zaffaroni, Carmen Argibay, Elena Highton De Nolasco, Juan Carlos Maqueda y Enrique Petracchi.
No obstante, la resolución no define la situación procesal del ex intendente de Escobar, quien está actualmente imputado en una causa por presunta violación a los derechos humanos y detenido en la c árcel de Mracos Paz con prisión preventiva.
A raíz de ello, Patti no podrá asumir por el momento, su situación procesal fue confirmada por la Justicia federal de San Martín a fines del año pasado, quien procesó al ex subcomisario bonaerense por los delitos de "privación ilegal de la libertad doblemente agravada, imposición de tormento y allanamientos ilegales" por secuestros y torturas de siete personas durante la dictadura.